Get Minimum and Maximum of records

You are grouping by CodigoCuentaand Descripcionbut those columns have distinct values. Maybe it can happen with other columns as well.

Here I leave an example of how to keep the different values, but get maximum and minimum of certain columns. Of course, it all depends on the rules of your information to group.

DECLARE @Fecha DATE ='2020-03-11' 
DECLARE @FechaInicial DATETIME = dbo.fnConvertirFechaDatetime(@Fecha,'I'),
            @FechaFinal DATETIME = dbo.fnConvertirFechaDatetime(@Fecha,'F')
SELECT 
            RazonSocial,
            Nit,
            IdComputador,
            FechaComprobante            ,
            NumeroInicialTransacciones  = MIN(NumeroInicialTransacciones) OVER( PARTITION BY RazonSocial, Nit, IdComputador, FechaComprobante),
            NumeroFinalTransacciones    = MAX(NumeroFinalTransacciones) OVER( PARTITION BY RazonSocial, Nit, IdComputador, FechaComprobante),
            CodigoCuenta,
            Descripcion,
            SerialComputador,
            CodigoIPS,
            NombreIPS,
            Usuario,
            NombreUsuario,
            NumeroRegistroRealizados    ,
            VentaEfectivo               ,
            VentaCredito                ,
            ValorTotalRegistrado        ,
            Exentas                     ,
            Excluidas                   ,
            Iva                         ,
            Descuento                   ,
            Letra                       ,
            NotaDebito                  ,
            NotaCredito                 ,
            Abono                       ,
            Deposito                    ,
            Subtotal                    
FROM( 
    SELECT 
                RazonSocial,
                Nit,
                IdComputador,
                FechaComprobante            = CONVERT(VARCHAR(10),FechaComprobante,111),
                NumeroInicialTransacciones  = MIN(Numerofactura),
                NumeroFinalTransacciones    = MAX(Numerofactura),
                CodigoCuenta,
                Descripcion,
                SerialComputador,
                CodigoIPS,
                NombreIPS,
                Usuario,
                NombreUsuario,
                NumeroRegistroRealizados    = COUNT(DISTINCT Numerofactura),
                VentaEfectivo               = SUM(VentaEfectivo),
                VentaCredito                = SUM(VentaCredito),
                ValorTotalRegistrado        = SUM(ValorTotalRegistrado),
                Exentas                     = SUM(Exentas),
                Excluidas                   = SUM(Excluidas),
                Iva                         = SUM(Iva),
                Descuento                   = SUM(Descuento),
                Letra                       = SUM(Letra),
                NotaDebito                  = SUM(NotaDebito),
                NotaCredito                 = SUM(NotaCredito),
                Abono                       = SUM(Abono),
                Deposito                    = SUM(Deposito),
                Subtotal                    = SUM(Subtotal)
        FROM  (
            SELECT 
                RazonSocial             = seriales.r_social,
                Nit                     = seriales.nit,
                IdComputador            = usuario.IdComputadorAsignado,
                FechaComprobante        = CONVERT(VARCHAR(10),@Fecha,111),
                Numerofactura           = (sis_maes.prefijo+sis_maes.NumeroFactura),
                CodigoCuenta            = cuentasUFView.cuenta,
                Descripcion             = cuentascont_zeus.descripcion,
                SerialComputador        = usuario.SerialComputador,
                CodigoIPS               = puntoAtencion.codigo,
                NombreIPS               = puntoAtencion.nombre,
                Usuario                 = usuario.usuario,
                NombreUsuario           = usuario.nombre,
                VentaEfectivo           = ISNULL((CASE WHEN contratos.FormasDePago='CD' THEN sis_deta.total ELSE 0 END),0),
                VentaCredito            = ISNULL((CASE WHEN contratos.FormasDePago='CR' THEN sis_deta.total ELSE 0 END),0),
                ValorTotalRegistrado    = ISNULL(sis_deta.total,0),
                Exentas                 = 0,
                Excluidas               = 0,
                Iva                     = ISNULL(sis_deta.ValorIva,0),
                Descuento               = 0,
                Letra                   = 0,
                NotaDebito              = 0,
                NotaCredito             = 0,
                Abono                   = 0,
                Deposito                = 0,
                Subtotal                = ISNULL(sis_deta.total+sis_deta.ValorIva,0)
            FROM sis_maes
                INNER JOIN seriales ON seriales.id = sis_maes.id_sede
                INNER JOIN usuario ON usuario.cedula = sis_maes.cod_usuario
                INNER JOIN sis_deta ON sis_deta.estudio = sis_maes.con_estudio
                INNER JOIN cuentasUFView ON cuentasUFView.id_ufc = sis_deta.id_cuenta
                INNER JOIN cuentascont_zeus ON cuentascont_zeus.cuenta =  cuentasUFView.cuenta COLLATE DATABASE_DEFAULT
                INNER JOIN puntoAtencion ON puntoAtencion.id = sis_maes.puntoAtencion
                INNER JOIN contratos ON contratos.codigo = sis_maes.contrato
            WHERE 
                sis_maes.nro_factura > 0 AND 
                sis_maes.estado='C' AND
                contratos.tipo_contrato<>1 AND
                sis_maes.fecha_egreso BETWEEN @FechaInicial AND @FechaFinal
            UNION
            SELECT 
                RazonSocial             = seriales.r_social,
                Nit                     = seriales.nit,
                IdComputador            = usuario.IdComputadorAsignado,
                FechaComprobante        = CONVERT(VARCHAR(10),@Fecha,111),
                NumeroFactura           = (pagos.prefijo+pagos.NumeroFactura),
                CodigoCuenta            = sis_tipo.cuenta,
                Descripcion             = cuentascont_zeus.descripcion,
                SerialComputador        = usuario.SerialComputador,
                CodigoIPS               = puntoAtencion.codigo,
                NombreIPS               = puntoAtencion.nombre,
                Usuario                 = usuario.usuario,
                NombreUsuario           = usuario.nombre,
                VentaEfectivo           = ISNULL(pagos.valor,0),
                VentaCredito            = 0,
                ValorTotalRegistrado    = 0,
                Exentas                 = 0,
                Excluidas               = 0,
                Iva                     = 0,
                Descuento               = 0,
                Letra                   = 0,
                NotaDebito              = 0,
                NotaCredito             = 0,
                Abono                   = 0,
                Deposito                = 0,
                Subtotal                = ISNULL(pagos.valor,0)
            FROM sis_maes
                INNER JOIN seriales ON seriales.id = sis_maes.id_sede
                INNER JOIN usuario ON usuario.cedula = sis_maes.cod_usuario
                INNER JOIN puntoAtencion ON puntoAtencion.id = sis_maes.puntoAtencion
                INNER JOIN pagos ON pagos.con_estudio = sis_maes.con_estudio
                INNER JOIN sis_tipo ON sis_tipo.id = pagos.fuente
                INNER JOIN cuentascont_zeus ON cuentascont_zeus.cuenta =  sis_tipo.cuenta COLLATE DATABASE_DEFAULT
            WHERE 
                pagos.NumeroFactura IS NOT NULL AND
                pagos.activo = 1 AND
                pagos.fecha BETWEEN @FechaInicial AND @FechaFinal
        ) Resolucion
        GROUP BY Resolucion.RazonSocial, Resolucion.Nit, Resolucion.IdComputador, Resolucion.FechaComprobante, Resolucion.CodigoCuenta, Resolucion.Descripcion,
            Resolucion.SerialComputador, Resolucion.CodigoIPS, Resolucion.NombreIPS, Resolucion.Usuario, Resolucion.NombreUsuario
    )R
    ORDER BY RazonSocial, NombreUsuario, CodigoIPS, CodigoCuenta